能够引起肩背部疼痛的原因还是比较多的，主要有两大类，一类就是运动系统本身出现了问题，包括肩背部的肌肉、筋膜、韧带、骨质。另一类就是内脏系统器官出现了问题，常见的包括心、肺、胃、胰腺、肝脏等脏器。
运动系统本身可能是由于损伤、劳损、炎症、感染、受凉、肿瘤等原因，导致结构出现破坏或者产生相应的刺激，从而产生疼痛。内脏系统器官出现疾病的时候，会反射性的引起肩背部的疼痛。
由于内脏系统器官的感觉神经和同一水平面的肩背部的感觉神经汇聚成同一根神经根进入到脊髓，所以，当内脏系统器官出现疾病产生疼痛的时候，可以经过神经根的反射导致肩背部出现疼痛。