矮小症是有可能遗传的，因为矮小症就是一组因为遗传或是疾病导致的生长发育障碍性的疾病。
其中以生长激素缺乏性矮小症为常见，它可能是家族性矮小或是体质性生长延迟，正常生长发育中的变异、生长发育迟缓等都是由遗传引起的。但也有可能是病理性因素，如营养不良、糖皮质激素治疗、胃肠道疾病、性早熟等也会诱发矮小症。
具体的病因要经过检查才能明确，因为矮小症是一种家族性遗传疾病，所以要避免近亲结婚，近亲结婚发生多基因遗传病的几率是大大提高的。