矮小症也不排除是家族遗传性疾病，但也并非绝对性先天性疾病，因为引起矮小症的病因有很多种。大约70%取决于遗传因素，有30%是源于后天因素，具体情况如下。
1.先天因素，如果家族中有矮小症或部分患者有，部分双亲患有矮小，子女出现矮小症的几率也会大大增加，可以归类为家族遗传性矮小，除此之外也可能是病理性先天遗传性矮小，最常见的就是小于胎龄或是染色体疾病等问题。
2.后天因素，包括慢性呼吸性疾病、代谢类疾病、骨骼类疾病以及营养不良等问题，都会造成患儿矮小症的现象。