甲硝唑和阿莫西林都是抗生素类药物，如果符合用药指征，两种药物可以一起服用。
甲硝唑主要针对厌氧菌以及滴虫感染的疾病，有很好的治疗效果。而阿莫西林主要针对需氧的细菌有杀灭作用，其没有抗厌氧菌作用，也无抗滴虫作用，所以有这类多种细菌感染情况的疾病可以共同使用。还有对幽门螺旋杆菌感染治疗时，也常会用到阿莫西林与甲硝唑联合用药。
两种药物没有配伍禁忌，共同使用不会影响彼此疗效，也无拮抗作用。但是要明确是否需要联合应用，如果滥用抗生素，也是有损身体健康。