开颅手术后头疼的原因较多，具体可能包括以下几个方面：
1.最为常见的为开颅手术后脑损伤、脑水肿仍然存在，颅内压力仍然较高且短期内无法完全恢复正常，会导致头疼、呕吐等颅内高压症状，需给予甘露醇、速尿，行脱水、利尿处理。
2.若手术过程中伴有蛛网膜下腔出血，会因血性脑脊液对硬脑膜的刺激而产生头疼，可考虑行腰穿反复释放血性脑脊液缓解或治疗。
3.手术以后三天内可能会因头部局部的切口未愈而出现头疼，可适当应用非甾体类止疼药物，如芬必得、塞来昔布等进行治疗。
4.若一周后仍然发生头部伤口疼痛或头疼现象，需考虑局部伤口或颅内是否发生感染，可行血常规、局部渗液或脑脊液的检查以明确诊断，并根据检查结果行清创、更换敷料及抗感染等治疗。