理论上来说，对不引起症状的肝胆结石来说，可以不治疗，仅需要定期的观察和随诊。
对于症状轻微或结石较小的情况，可以通过保守治疗，包括饮水和运动，配合解痉止痛，消炎利胆，以及鸡内金和熊去氧胆酸等溶石药物，进行排石治疗。
但目前临床上对于肝胆结石首选的治疗方式为手术，具体的手术方案需要根据患者的实际情况而定，比如胆囊结石最常用的手术方式是腹腔镜下胆囊切除术，对于大部分的肝外胆管结石，经常采用腹腔镜下胆管切开取石术，对于部分肝内胆管结石而言，可能需要进行肝叶切除或肝移植。