虽然金水宝胶囊是一种补益肺肾的中成药，用于治疗肺肾亏虚所引起的脾虚乏力和久咳虚喘症状。但是并不适用因外感病症而引起的咳嗽症状的治疗，比如由于发烧感冒原因，引起的神疲乏力、咳嗽、咳黄痰等，这种情况的患者就不适用金水宝胶囊调治。
金水宝胶囊的主要药物成分，是一种发酵的虫草菌粉。如果属于对虫草药物过敏的患者，也属于不适用人群。
此外，儿童、哺乳期女性、孕妇等这类特殊群体，如果因病情需要服用金水宝胶囊时，一定要在医师的指导下使用。