功能性胃肠病的患者想要治愈，需要先消除患者的不良情绪，然后根据患者所出现的症状，对症使用药物进行治疗。
而且在日常生活当中，还需要多注意，避免吸烟、喝酒、喝浓茶及咖啡，还要控制刺激性食物的摄入量。平时还需要放松心情，必要时服用一些镇静药物进行治疗。
目前对于功能性胃肠病的患者，尚无特效的药物进行治疗。在进行治疗时，需要根据患者所出现的症状，针对性地选择药物，甚至也可以在中医师面诊后，选择中药方剂进行调理，但是功能性胃肠病的病程比较长，有可能会出现复发。