输卵管结扎也有可能会发生宫外孕。输卵管结扎术后发生输卵管部位异位妊娠的几率达到10%到20%，尤其是腹腔镜下电凝输卵管及硅胶环套术结扎，有可能造成输卵管瘘或再通，而导致输卵管通而不畅，从而引起宫外孕。
所以，即使进行了输卵管结扎，如果停经后出现腹痛、阴道流血等相关症状，也要考虑宫外孕的可能，要进行尿妊娠试验或者抽血测HCG。如果在宫腔内未见到孕囊，而在宫外见到了异常的包块，也是要考虑宫外孕。
除了输卵管结扎会导致宫外孕之外，输卵管部位的其他手术，如输卵管粘连分离术、输卵管成形术都有可能导致宫外孕，以及宫内节育器避孕失败、口服避孕药避孕失败，发生宫外孕的机会也比较大。