治疗肠瘘最好的方法是根据患者的病情的不同，给予相应的治疗方法，一般考虑的是保守治疗以及手术治疗。
在治疗方面，如果一旦确诊为肠瘘，首先应该给予抗炎、补液治疗，并且应该禁食水。补液的时候应该综合再进行考虑，给予患者足够的能量以及热量。
同时还应该纠正各种紊乱，如果不能自行修复的患者，需要积极手术治疗。一般可给予局部的瘘管切除，并且这里损伤的肠道进行修补，也可以采用局部的肠道切除后进行吻合。具体的手术方式，主要是根据术中情况所决定。