肛瘘区别高位和低位，有以下几方面的情况：
1.低位肛瘘。从解剖部位上区分为内口，通常位于外括约肌皮下或浅表部位，与皮肤相通。高位肛瘘，内口通常走行在外括约肌深层以上。
2.肛瘘高位和低位的术前判断，通常需要影像学检查来明确。主要的检查方法有经直肠内超声、盆腔核磁共振，以及从肛瘘外口注射造影剂，后行肛瘘造影检查，可明确肛瘘的位置及复杂程度。高位肛瘘和低位肛瘘都有简单瘘和复杂瘘两种情况。复杂肛瘘通常有多个外口，偶可见多个内口情况。
术前了解肛瘘位置的高低，对于手术治疗有帮助。