肺真菌感染患者喝黄芪可能存在着副作用。黄芪一般适用于阴虚湿热的患者，但是，肺真菌感染属于西医的疾病概念，不同患者可能出现不同症状，属于中医的不同表征，不一定都适宜喝黄芪。
肺真菌感染包括直接吸入含有真菌或其孢子的气体和粉尘引起的直接感染，和继发于全身真菌感染的疾病。本病多见于免疫力较低下的人群，例如艾滋病患者、恶性肿瘤患者因为器官移植等必须长期服用免疫抑制剂的患者等。本病的治疗往往需要使用抗真菌药，包括有两性霉素B、卡泊芬净、伏立康唑等。