夫妻关系不和谐有可能会引起性交疼痛。因为夫妻关系不和谐，容易使女性心情抑郁、精神压力过大、情绪低落等，这些不良因素就比较容易影响女性卵巢内分泌功能，导致内分泌失调，引起女性阴道分泌物减少等情况。
而且夫妻关系不和谐，同房的时候女性容易不在状态，因为女性比较感性，如果不在状态，心情不好就会影响内分泌功能，导致阴道分泌物不足，同房的时候就会出现摩擦性疼痛症状。
而且夫妻关系不和谐，还容易引起女性出现月经不调等情况，严重影响女性身体健康。