生殖道支原体感染在临床上，绝大部分首选的就是阿奇霉素进行口服治疗。但是，如果是反复的支原体感染的病人，就建议可以做阴道分泌物的细菌培养加药物敏感试验，根据结果再给予相应的用药，针对性会更强一些。
另外，如果是支原体感染，性伴侣也有感染的情况下，建议同时用药进行治疗，就避免了交叉感染的可能性。并且，在治疗期间不可以有性生活，在临床症状完全消失之后，通过实验室检查如果转为阴性才认为是治愈，才可以有正常的性生活。
支原体感染在临床上是条件致病菌，当具备一定条件的情况下才会引起相应的症状。而对于没有症状的支原体感染临床不用治疗，有症状才需要治疗。