患者出现吞咽困难时，要根据患者的具体情况采取不同的治疗方式。
如果是食管癌患者所出现的吞咽困难，可采取手术治疗或者插管方式治疗，若后期无法进食需要给予蛋白质、营养输液、脂肪酸，以保证机体营养所需。
如果是中枢神经系统疾病患者出现吞咽困难时，要先给予插管治疗，以免患者在饮水或者进食的时候，引起呛咳导致肺部感染。在治疗期间，还要积极进行神经系统疾病的对症治疗。另外对这类的患者还需要给予积极的康复治疗，通过对吞咽功能的康复训练，以助其尽早的恢复其正常功能。