正常情况下母乳性腹泻是会出现自愈现象的。导致母乳性腹泻的主要原因，是由于母乳当中的前列腺素水平比较高，引起患儿小肠平滑肌蠕动过快，从而产生的腹泻症状。
临床上也有一小部分患儿出现母乳性腹泻，是由于对母乳当中的乳糖不耐受所引起的，患儿主要表现为腹痛以及腹泻等不良的症状，但是患儿的精神状态良好，并且患儿的生长发育正常。一般宝宝的胃肠功能发育逐渐完善后，母乳性腹泻的症状，就会逐渐好转，大概需要在宝宝六个月以后。
临床上对于母乳性腹泻比较严重的患儿，可以通过服用中药来进行治疗，缓解症状。