肛裂可以涂抹的药膏较多，比如百多邦软膏、湿润烧伤膏、硝酸甘油软膏、黄连膏、生肌玉红膏、痔疮膏、红霉素软膏等，这些药膏可以清热解毒、止血、止痛、消炎，能够促进伤口愈合。
除了局部涂抹药膏。还可配合用中药坐浴治疗，常用的中药方剂主要有消肿止痛汤、苦参汤，可以活血化瘀、消肿止痛。这些药物对于早期形成的新鲜肛裂具有较好的效果，大多用药一个星期左右就可以治愈。
但是，如果已经形成陈旧性的肛裂，单纯涂抹药膏是无法治愈的，需要做手术才能够根治。