药物性狼疮与系统性红斑狼疮是不难进行区分的。
因为药物性狼疮就是由于长期服用某种药物后所导致的狼疮样的病变和症状，其区别主要在于有明显服药病史，并且很少会有系统脏器的损害。药物性狼疮也可能会有抗核抗体的阳性，但是与系统性红斑狼疮的区别是很少会有大量自身抗体的表现，抗双链DNA抗体、抗SM抗体都是阴性，血清补体也大多是正常的。
所以与系统性红斑狼疮不难进行区别，系统性红斑狼疮会有肾脏损害，还可能有神经系统表现，其它多脏器损害的特点。