卵巢囊肿腹腔镜手术后怀孕的几率的大小，需根据手术的方式、囊肿的性质，一侧还是双侧综合评估。对单纯性囊肿手术中没有异常情况，一侧的卵巢囊肿，术中行的囊肿的剥除术，术后卵巢的皮质功能基本保持完整，一般对怀孕的影响不大，怀孕的机会还是很大的。
对于术中卵巢囊肿有粘连，尤其是发生为双侧的卵巢囊肿，卵巢的皮质功能破坏很多，有些甚至切除一侧卵巢的，以后怀孕的机会就会有明显的影响，甚至有不孕的可能。所以对于腹腔镜手术后的卵巢囊肿术后怀孕的机会由很多的因素确定。
对于有生育要求的女性，需尽量的保留卵巢的组织，尽量避免手术对卵巢的伤害，需要尽量保留卵巢的功能，从而可以明显的提高术后怀孕的机会。