怀孕三个月检查胚胎停育，就只能接受尽早的流产手术，也是要根据孕囊的大小来决定做清宫手术，还是吃药来帮助死亡胚胎排出来。
怀孕三个月已经检查到是胚胎停育，没有胎心管搏动，就必须是立即住院，不能等待。因为等时间越长，死亡的胚胎诱发促凝物质，进入母亲血液循环中，导致将来发生母体凝血功能障碍的几率就会越大，将来发生大出血的几率就会越大。
伴有阴道出血情况的孕妇也是会随着出血时间的延长，感染几率也是会越来越大。