指甲上有黑色可能为指甲外伤所引起，比如在平时的生活、工作当中如果不慎指甲被踩伤或受到重物挤压等，都容易导致指甲部位受损致使甲床下出血，进而造成甲床下产生淤血，可表现为指甲部位有黑色。
也可能是由于甲母细胞痣所引起，通常出现在指甲的根部，主要是由于甲母痣中含有黑色素细胞团块。这些黑色素细胞容易渗入到指甲当中，进而造成指甲上出现黑色。
另外，还可能为感染性的因素所引起，主要是由于指甲部位受到细菌、真菌等病原菌感染，致使该部位产生黑色素，也会造成指甲发黑。