扁桃体炎的治疗包括保守治疗、药物治疗和手术治疗，快速治疗以输液治疗见效最快。
急性扁桃体炎或是慢性扁桃体炎急性发作时，首选抗生素治疗，抗生素首选青霉素类。根据炎症的严重程度来选择给药方式，炎症较轻时可以口服药物治疗为主；炎症较重时可以输液青霉素类抗生素，必要时加用糖皮质激素。总体来说，输液效果肯定要好于口服药物治疗。
慢性扁桃体炎患者扁桃体炎反复发作，每次都需要药物保守治疗，部分患者经常会伴有发热，这种情况建议在炎症控制稳定的前提下，可以考虑手术治疗。