藿香正气水对灰指甲的治疗是没有直接功效的，灰指甲在医学上称为甲癣，是真菌感染所引起的甲病，藿香正气水的主要功效是解表化湿，理气和中。主要成分有苍术，陈皮，白芷，茯苓，半夏，紫苏叶油等，藿香正气水的功效和成分均没有抗真菌的作用。灰指甲外涂药物主要有罗美乐盐酸阿莫罗芬甲搽剂，可以有效的抑制和杀灭真菌，该药使用方便，涂于病甲，每周一到2次即可。需要注意的是，使用药物前需要用温水泡脚，把指甲泡软以后再使用药物，这样才会容易吸收，并且要坚持使用。如果有手癣、足癣和体癣，需要同时治疗，以免真菌消灭不彻底而引起灰指甲的复发。