溃疡性肠炎以反复发作的腹泻、粘液脓血便及腹痛为主要临床表现，起病大多数为亚急性，少部分病人急性起病，病程呈慢性经过，发作与缓解交替，极少数症状持续并逐渐加重。溃疡性肠炎治疗的目的是控制急性发作，促进粘膜愈合，维持缓解和减少复发，防治并发症。
控制炎症可以选用5-氨基水杨酸，糖皮质激素及免疫抑制剂。5-氨基水杨酸几乎不被吸收，可抑制肠粘膜的前列腺素合成，炎症介质白三烯的形成，对肠道炎症有显著的抗炎作用。常用的药物有柳氮磺吡啶、美沙拉嗪、奥沙拉嗪。糖皮质激素对急性发作期有较好疗效，可用于对5-氨基水杨酸疗效不好的轻、中度患者，特别适用于重度的患者。免疫抑制剂硫唑嘌呤或巯嘌呤可适用于对激素治疗效果不佳或对激素依赖的慢性持续性病例，加用这类药物可逐渐减少激素用量甚至停用。缓解期控制炎症主要用5-氨基水杨酸做维持治疗。及时的纠正水电解质平衡紊乱，贫血的可以输血，低蛋白血症的要补充白蛋白，病情严重的进行完全胃肠外营养治疗。