大便后肛门疼有如下原因：
1.便秘导致的粪便硬结。当便秘时，大便水分会被吸收过度，导致大便硬结或者粗大。在排便时，肛管扩张过度，可以引起大便后肛门疼痛的症状。需要注意，如果大便时还伴有出鲜血的症状，则考虑为肛裂，要及时进行治疗，避免变成慢性肛裂。
2.排便过于频繁引发的肛门刺激征。由于排便习惯的改变，一天多次排便会导致肛管反复扩张以及肛门部位被反复摩擦，从而引发肛门疼痛，大多有火辣辣的感觉或者刺痛感。
3.消化道刺激。多见于近期食用较刺激的食物，从而加速蠕动和排出的过程。由于胃肠道对应神经较少，所以多表现为排便后肛门疼痛，尤其有灼热性疼痛。