男性生殖器畸形大多数是先天性的，也有小部分是后天外伤、疾病所造成的，一般是因为在胚胎发育时，因为各种因素引起睾丸分化不是很完全，就可能会出现睾丸萎缩、变形的情况。
有的患者生殖器官畸形不是很严重，一般是不会影响正常的排尿，也不会影响到性生活，有的患者也能正常的排泄精子，但是也有一部分的患者可能会影响到正常的生活。
所以如果有一些男性生殖器官畸形比较严重，可以进行手术纠正治疗，后期预后效果还是可以的，术后要注意保养，注意不要着凉，也要保证会阴部位的卫生清洁。