肝脓肿是否需要做手术，要视病情的轻重来决定，比较严重的需要做手术的。
肝脓肿是细菌、溶组织阿米巴原虫等多种微生物感染，导致肝脏出现化脓性的病变。细菌性引起的肝脓肿，可全身支持治疗应用抗生素治疗，也不需要做手术治疗。单个较大的脓肿可以穿刺吸脓，或者经皮肝穿刺脓肿置管引流术，将脓肿引流出来，再应用全身抗感染药物治疗。
肝叶切除术，通常适用于慢性的局限肝病、肝脓肿、肝炎受到严重的破坏已经失去了功能。阿米巴原虫引起的，可以给予全身的抗真菌药物治疗。