汉坦病毒所引起的疾病与鼠疫不同。虽然两类疾病的主要传染源皆为鼠类，但是由于其发病表现、实验室检查、预后以及病死率等均存在明显的差异，故而两类疾病不可以一概而论。
鼠疫由于其高病死率及传染性，与霍乱同属于甲类传染病，而汉坦病毒所引起的流行性出血热仅属乙类传染病。并且鼠疫由于各自主要症状不同，可以分为腺、肺、败血及轻型四种临床分型，以发热寒颤为主要表现，甚则出现中枢性的呕吐，而汉坦病毒所引起的肾综合征出血热所具有的肾功能损害等表现，并不是鼠疫所必须具有的。
综上所述，二者并不是同一类疾病。