男性小便有刺痛感有可能自愈，与自身免疫力是否正常有关。如自身免疫力较强，自愈的可能性较大，若自身免疫力明显降低，则自愈的可能性较小。
小便有刺痛感可由尿道口外伤、龟头炎，或急性尿道炎引起。龟头炎及急性尿道炎一般是由细菌感染所致，病情较轻者在增加饮水，避免进食辛辣刺激性饮食等处理后可自愈。但如果免疫力低下者，感染可能会在短时间内加重。所以，对于这类人群应尽早予以抗炎治疗，可口服左氧氟沙星胶囊等药物治疗。
而尿道口外伤则是物理性损伤，不严重时多数患者可自行愈合，但应增加饮水、多排尿，以预防尿道口破损处继发细菌感染。