妊娠合并肾盂肾炎的鉴别诊断主要是要与泌尿系统结石、阑尾炎等疾病相鉴别。
妊娠合并肾盂肾炎主要是由于怀孕以后孕激素导致输尿管蠕动减慢容易导致肾盂积水，并且增大的子宫可以压迫输尿管导致肾盂积水，继而引起细菌感染的时候，容易导致肾盂肾炎的发生。出现肾盂肾炎时主要表现为肾区的叩击痛以及发热的症状。此时我们首先要与泌尿系结石相鉴别，泌尿系结石的尿常规检查中多可见大量的红细胞，并且其疼痛部位不定。如果是右侧的肾盂肾炎，要与妊娠合并阑尾炎相鉴别。
阑尾炎在妊娠期疼痛的部位并不固定，可以通过CT或者B超检查进行了解阑尾的情况。