新冠肺炎可以导致器官衰竭，特别是见于重症和危重症病例。
对于普通型和轻症新冠肺炎患者，一般是不会导致器官的功能衰竭，此类患者病情相对较轻、预后也良好。但对于重症病例，常常可以导致机体多器官的功损害或衰竭，其中以呼吸衰竭最为多见。此时患者可以伴有严重的低氧血症，部分患者还伴有二氧化碳潴留的现象。此外严重病例常常可以继发心功能衰竭和肝肾功能的衰竭，部分患者还可以伴有消化系统功能紊乱或衰竭的现象。临床上对于危重症病例伴有多器官的功能衰竭时，患者的死亡率明显增大。
故对于重症新冠肺炎患者在抗感染的同时，还要维护器官的功能稳定，防止并发症，以降低其病死率。