对于怀孕后的女性，如果开始检查有胎心，但后来又出现胎停，最大的原因可能是因为胚胎本身的质量问题所引起的。
有可能是因为卵子的质量不佳，或者是精子畸形；还有可能是因为胚胎自身的染色体发育异常；也有可能是女性怀孕以后黄体功能不足，其体内的孕激素水平，不能够满足胚胎的正常生长发育，所以也可能会发生胚胎停育，还可能出现自然流产现象。
而且有些胎停的女性还是由于子宫畸形导致，比如纵隔子宫或者残角子宫的女性，就有可能会发生胚胎停育，通常都需要在胎停以后，尽快流产来终止妊娠。