心房颤动主要是由于器质性心脏疾病导致心房有序规则的电活动丧失，取而代之的是快速且没有规律的颤动波，引起心房的电活动紊乱。常见的可以引起心房颤动的器质性心脏病，主要有高血压性心脏病、风湿性心脏病、冠状动脉粥样硬化性心脏病以及缩窄性心包炎、慢性肺源性心脏病等。
除了心源性的因素可以引起房颤外，一些正常人在某些特殊的情况下也会发生房颤。如大量饮酒、情绪激动、剧烈运动或者是有手术创伤等情况。
当出现房颤应当及时进行心电图、动态心电图、以及超声心动图等检查，明确引起房颤的原因，并通过服用药物、射频消融术等方式转复心律。