肛门有黄水，有可能是存在肛瘘的情况。肛瘘的外口通过管道和肛内相通，会反复流脓、流水，特别是一些黄色的粪水，可以经管道通过外口进行排出，表现为肛门有黄水的情况。
肛门有黄水除了肛瘘以外，也要排除其他肛门处的一些常见疾病，比如有痔疮的存在。痔疮在急性发作期，内痔部分脱出的，外痔部分有水肿、发炎的，都可能会导致肛门闭合不严，进而会使肠液或者是粪水外溢，表现为肛门有黄水的情况。
再者，肛管直肠内受到细菌感染之后，出现了化脓性炎症，也可以表现为肛门有黄水的情况。可以到肛肠科就诊，明确诊断，及时对因、对症治疗。