首先是对皮样囊肿周围的皮肤进行清洗，手术前需要以皮样囊肿的中心为主，用碘伏消毒周围直径为15公分的区域，然后在肿物周围垫上手术铺巾。再对肿物进行局部麻醉。
麻醉的药量需要根据肿物的大小来进行调配，肿物大就多配点麻药。如果肿物较小，手术时可在肿物中心做一个横行切口，然后用组织镊将囊肿慢慢地分离。
最好是能够保证囊肿的完整性，就可以减少感染的发生几率。如果肿物比较大，可以做一个梭形的切口，手术后可以达到治愈。