甲型h1n1流感的危害有以下几个方面：首先是它的传染性，甲型h1n1流感的传染性是很强的，它属于乙类传染病，如果未早期发现感染者，并未及时予以隔离治疗，容易导疫情的蔓延，甚至是爆发，导致患病人数明显的增多，有可能导致严重的社会公共卫生安全问题等。
其次就是病毒感染对身体的危害，甲型h1n1流感常导致病毒性呼吸道感染，使患者出现畏寒、发热、全身酸软乏力，还可以继发病毒性肺炎，患者可以有咳嗽胸闷、呼吸困难的症状。
对于少数患者可形成重症肺炎，患者可以继发呼吸衰竭，甚至是多脏器的功能损害或衰竭，也有一定的死亡率，故甲型h1n1流感危害很大。