气管食管瘘病因很多，有局部的炎症、感染、损伤、胸部术后并发症等，食管癌、支气管肿瘤也是一种造成气管食管瘘的原因，但不是所有的气管食管瘘都是食管癌导致的。
食管癌的病人如果肿瘤较大，突破患者食管外膜，侵犯到食管周围的气管或者左主支气管，肿瘤会长入患者气管，导致气管和食管外膜破裂，气管和食管相通，形成气管食管瘘。
食管癌所致的气管食管瘘因为是晚期肿瘤导致的，手术难度较大，且不能达到肿瘤根治，可采取保守治疗，置入食管以及气管带膜支架，隔开瘘口。