目前在临床上认为多囊卵巢综合征的具体的致病原因尚不明确，与多方面的因素有可能相关。
多与遗传因素、营养因素、环境因素、精神因素等有关。比如如果母亲确诊患有多囊卵巢综合征，或者母亲有月经稀发、月经过少、肥胖，父亲有秃顶，家族中或者有糖尿病异常等代谢有问题的患者，该女性患有多囊卵巢综合征的风险则相对增加。
多囊卵巢综合征还与肥胖以及排卵障碍、高雄激素血症存在一定的相关性。如果女性长期的抑郁、精神焦虑、紧张，有可能会促进多囊卵巢综合征的进展。