1.肾棘球蚴病，首选的治疗方法为手术治疗。通过手术切除肾包虫囊肿，而首选的抗包虫病的药物为阿苯达唑及甲苯达唑。
2.滴虫性尿路感染，首选甲硝唑或者替硝唑抗感染治疗，此病通常伴随细菌性尿路感染，需要联合抗生素进行治疗。有性伴侣的，应同时进行治疗，治疗期间禁止性生活。
3.尿路丝虫病，目前一般采用乙胺嗪和卡巴胂治疗，而针对微丝蚴，应用左旋咪唑效果较好。
4.尿路阿米巴病，首选甲硝唑。 如果出现肾阿米巴脓肿或者是肾周阿米巴脓肿，视病情决定是否需要切开引流。