咳嗽久治不愈，主要有以下原因：
第一，患者为感染后咳嗽，需要漫长的过程，此时建议中药调理。
第二，所使用的抗菌药物不敏感或没有覆盖到病原体，建议完善痰培养或取肺泡灌洗液，明确病原体对因治疗。
第三，是否为过敏性咳嗽，如果为过敏性咳嗽，可考虑抗过敏治疗，必要时予以吸入糖皮质激素。
第四，应完善支原体、衣原体抗体，是否为支原体肺炎，如考虑为支原体肺炎，应予以大环内酯类药物抗感染。
第五，应完善肺部CT检查，如考虑为肺恶性肿瘤应根据病理结果采取放疗、化疗或手术治疗。