侵袭性肺曲霉病临床治疗困难，病死率高。
侵袭性肺曲霉病多为局限性的肉芽肿或广泛化脓性肺炎伴脓肿形成。症状可有干咳、胸痛、部分患者可有咯血、病变广泛时出现气急、呼吸困难，甚至呼吸衰竭。
治疗主要予以抗真菌治疗为主。首次宜从小剂量开始，尽快尽可能给予最大耐受剂量程度，然后维持治疗。目前对总疗程、总剂量没有统一的意见，可以根据患者病情的程度，对治疗的反应，基础疾病或免疫状态个体化给予，疗程一般为6到12周。