头皮癣在治疗上一般要达到除根的目的，主要是进行抗真菌治疗。因为头皮出现的癣主要是感染了癣菌，特别是皮肤癣菌而形成白癣，黄癣，或者是形成黑点癣等，对于这些癣类的头皮疾病，主要是通过口服抗真菌类的药物，特别是选择伊曲康唑，特比萘芬、灰黄霉素等进行口服治疗。
一般在口服这些药物之前，需要检查患者的肝肾功能等。如果检查出这些内脏器官没有明显的损害，通常可以口服治疗。
但是如果有一定的损害，一般不主张口服这些药物治疗，可以相应地使用一些外用药物治疗，比如可以外涂特比萘芬乳膏，或者外涂硝酸咪康唑乳膏等。