肺真菌感染和肺结核感染的区别主要有以下几点：
首先，它们感染的病原体是不一样的。真菌感染顾名思义是肺部感染了真菌；而肺结核感染主要是感染结核杆菌。
第二，它们之间的临床症状也是不一样的。像真菌感染一般会有咳嗽、咳痰和发热的症状，而发热一般是高热为主；而肺结核的症状有咳嗽、咯血、低热，以午后低热比较常见。
最后，它们的治疗也不一样。对于肺真菌感染它的治疗主要是以抗真菌为主；而对于肺结核主要是以抗结核杆菌为主，遵循是早期、适量、规律、联合、全程的治疗原则。
所以，二者是有区别的，临床上可以通过痰细菌培养对二者进行鉴别。