对于附睾囊肿是不会癌变的，因为附睾囊肿属于附睾部位的良性占位性病变。并非恶性肿瘤，囊肿内部一般都是由精液构成，并非实质性占位，对于附睾或者睾丸的恶性肿瘤主要都是实体肿瘤，内部都是实质的细胞，而对于囊肿内部主要都是液性暗区，一般都是有精液构成。因此是不会恶变的，也不用过度担心，不需要进行特殊治疗。
目前也没有任何药物可以将附睾囊肿祛除，患者只需要进行定期的泌尿系彩超、阴囊彩超检查就行，如果阴囊彩超判断附睾囊肿进行性增大，如果增长过大，那么可以进行手术，将囊肿切除。