非结核分枝杆菌病和肺结核：
首先，不同致病菌感染导致，前者是非结核分枝杆菌的感染，后者是结核分枝杆菌的感染。
其次，非结核分枝杆菌病多见于免疫力低下的人群，健康人很少发病。而肺结核的发病率较高，不仅可以见于免疫力低下的人群，健康人也能发病。
最后，非结核分枝杆菌病和肺结核有一定的相似性，有时临床表现，胸部CT等相关的检查都有一定的相似性，痰抗酸染色都可以出现阳性。但是可以通过痰分枝杆菌的培养，或者二代基因测序等相关的方法进行鉴别。