肺部被真菌感染是否需要住院和疾病的严重程度有关。如果病人只是出现轻微的咳嗽、发热以及浑身无力的现象，一般不需要住院治疗，可以在家口服抗真菌的药物缓解症状。
但是如果病人出现比较严重的呼吸困难、咳嗽以及高烧的现象，在家自服口服药物治疗的效果并不明显，就要积极住院进行治疗。通常情况下，病情不太严重的真菌肺炎，通常住院输注抗真菌药物2~3周的时间可以改善病情，之后可以出院在家口服药物继续治疗。
如果病情比较严重，住院治疗时间通常需要1个月。常用的抗真菌药物包括有氟康唑、伏立康唑。