男性生殖系统患有结核菌感染，多数是由于肺结核这种疾病，通过血液途径或者是通过淋巴途径，继发了男性生殖系统的结核杆菌。
无论是哪一种途径导致的男性生殖系结核，一旦确诊感染结核性的疾病，应该及时采取抗结核的药物进行治疗。
需要遵循医嘱选择足量的抗结核药物，在用药期间还应该定期检查肝功能，预防药物造成药物性肝损，通过及时治疗，一般3~6个月男性生殖系结核是可以完全康复的，应该树立战胜疾病的信心。
此外可以注射卡介苗，预防家人的交叉感染。