三腔起搏器是在心脏的三个心腔内分别放置起搏电极，通过起搏电极来起搏心脏。
电极一般是位于右心房、左心室、右心室，这种三腔起搏器的功能是模拟了正常的生理起搏。一般是先起搏心房，然后再起博心室，导致心房和心室按顺序进行收缩。
这种起搏器更符合人体的生理起搏，一般可以用于各种病窦综合症或者房室传导阻滞的治疗。在严重的心脏功能衰竭的情况下，也可以使用这种起搏器来治疗。可以使心脏的左右心室起搏更趋同步，从而改善心脏的射血功能。