男性精液囊肿，可以通过药物治疗或手术治疗。
如果囊肿较小，没有明显的症状，可以不用治疗，定期做检查观察病情进展，随访即可。也可以应用中药进行治疗，主要以化痰散结、疏肝理气、化湿除湿、滋阴降火的药物调理。
但如果囊肿比较大，有明显的临床症状，则需要进行手术切除囊肿，否则过大的囊肿，有可能会影响性功能障碍。因为体积较大的囊肿会压迫睾丸，从而导致局部的血液回流不畅，容易引起睾丸萎缩，在性生活时会出现疼痛，患者会出现焦虑的心理状态，从而引起阳痿、早泄。