骨不连可能会导致肌肉萎缩、关节僵硬等后遗症。
如患者长期制动，肌肉缺少活动就会引起肌肉萎缩，同样患处相邻的关节长期地固定，缺少活动也会引起关节僵硬，多数患者在通过及时有效的诊断治疗后，预后良好，配合医生做好恢复期的功能锻炼，以避免发生肌肉萎缩、关节僵硬等后遗症出现。
骨不连多发生在骨骼发生损伤或者骨折后，如果患处9个月没有愈合，治疗超过3个月没有改善就可以定义为骨不连，会造成骨折断端微动、疼痛等症状，应当及时地停止影响骨折愈合的药物，加强营养，通过药物或者手术进行治疗。